PDB 파일 형식은 단백질, 핵산 및 복합체와 같은 거대 생체 분자의 3차원 구조를 표현하기 위해 생물정보학 및 구조생물학에서 광범위하게 사용되는 표준 구조 파일 형식입니다. 단백질 데이터 은행(Protein Data Bank)에서 개발한 이 텍스트 기반 파일에는 원자 좌표, 2차 구조 할당, 실험 메타데이터, 그리고 결정학 또는 NMR 데이터가 포함되어 있습니다. 연구자와 과학자들은 분자 구조를 시각화하고, 전산 도킹 시뮬레이션을 수행하며, 단백질-리간드 상호작용을 분석하고, 분자 동역학을 연구하기 위해 PDB 파일에 의존합니다. 사람이 읽을 수 있는 구조 덕분에 과학자들은 사용자 정의 스크립트나 특수 분자 시각화 소프트웨어를 사용하여 원자 레코드를 쉽게 파싱함으로써 생화학적 기능과 신약 개발 과정에 대한 통찰력을 얻을 수 있습니다.