Il formato di file MOL, comunemente noto come MDL Molfile, è un formato di file chimico standard utilizzato per memorizzare informazioni su atomi, legami, connettività e coordinate delle molecole chimiche. Sviluppato da Molecular Design Limited (MDL), questo formato è ampiamente utilizzato nella chemiinformatica e nella chimica computazionale per rappresentare strutture molecolari in modo facilmente leggibile sia dagli esseri umani che da software specializzati. Un tipico file MOL è costituito da un blocco di intestazione con metadati, una tabella di connessione contenente gli elenchi degli atomi con le relative coordinate cartesiane 3D o 2D, e un elenco dei legami che descrive in dettaglio come gli atomi sono connessi e il tipo di legami coinvolti. Grazie alla sua standardizzazione e semplicità, funge da formato fondamentale per la condivisione di dati chimici tra vari database chimici, software di modellazione molecolare e quaderni di laboratorio elettronici.