O formato de arquivo MOL, comumente conhecido como MDL Molfile, é um formato padrão de arquivo químico usado para armazenar informações sobre átomos, ligações, conectividade e coordenadas de moléculas químicas. Desenvolvido pela Molecular Design Limited (MDL), este formato é amplamente utilizado em quimioinformática e química computacional para representar estruturas moleculares de uma forma que seja facilmente legível tanto por humanos quanto por softwares especializados. Um arquivo MOL típico consiste em um bloco de cabeçalho com metadados, uma tabela de conexão contendo listas de átomos com suas coordenadas cartesianas 2D ou 3D, e uma lista de ligações detalhando como os átomos estão conectados e o tipo de ligações envolvidas. Devido à sua padronização e simplicidade, ele serve como um formato fundamental para o compartilhamento de dados químicos em vários bancos de dados químicos, softwares de modelagem molecular e cadernos de laboratório eletrônicos.