Формат файла MMTF (Macromolecular Transport Format) представляет собой высокоэффективное бинарное представление, разработанное специально для хранения и передачи крупномасштабных 3D-структур макромолекул, таких как белки, ДНК и РНК. Созданный для решения проблем с производительностью традиционных форматов структурной биологии, таких как PDB и mmCIF, MMTF использует сериализацию MessagePack для достижения значительно меньшего размера файла и более высокой скорости синтаксического анализа (парсинга). Это делает его исключительно подходящим для веб-визуализации молекул и интерактивных биоинформатических приложений, где пропускная способность сети и производительность рендеринга имеют критическое значение. Путем сжатия координатных данных, атомных свойств и структурных метаданных в компактный бинарный поток, MMTF позволяет исследователям передавать и визуализировать массивные биологические комплексы непосредственно в веб-браузерах и специализированном научном программном обеспечении без значительных задержек или чрезмерного потребления системных ресурсов.